A estrutura curricular do PPGO tem por objetivo proporcionar a formação de profissionais aptos tanto na formação docente quanto na construção de projetos que visem a melhorar os serviços em que atuam no desenvolvimento de pesquisas focadas na realidade da região que ainda apresenta níveis de saúde necessitados de olhar sensível a melhorias. As disciplinas do PPGO/UFPI são semestrais e para integralizar o curso, o aluno deve cumprir o mínimo de 30 créditos, sendo 24 em componentes curriculares (disciplinas e atividades didático-pedagógicas) e seis (6) créditos computados após aprovação da defesa da dissertação.

As disciplinas obrigatórias são:

1. Bases Epidemiológicas em Odontologia (2 créditos)

2. Didática no Ensino Superior (2 créditos)

3. Estágio Docência I (4 créditos)

4. Estatística Aplicada à Pesquisa Odontológica (3 créditos)

5. Metodologia da Pesquisa (2 créditos)

6. Dissertação (6 créditos)

7. Projetos (2 créditos)

8. Estágio Docência II (4 créditos).

As disciplinas optativas ofertadas são:

1. Odontologia para Pacientes Especiais (2 créditos)

2. Tecnologia Aplicada a Odontologia (2 créditos)

3. Tópicos Avançados em Odontologia (2 créditos)

4. Tópicos em Odontopediatria (2 créditos)

5. Tratamentos Integrados em Odontologia (4 créditos)

6. Bioética (2 créditos)

7. Defeitos de Desenvolvimento do Esmalte Dentário (2 créditos)

8. Patologia e Diagnóstico Bucal (2 créditos)

9. Apresentações em Inglês (2 créditos)

10. Terapia Pulpar em Dentes Decíduos (2 créditos)

11. Reabilitação Oral (2 créditos)

12. Odontologia Baseada em Evidências (2 créditos).