Objetivo: O presente estudo investigou a combinação dos polimorfismos SLC6A3 3’-UTR e intron 8 VNTRs na tarefa de estimativa de tempo e na potência alfa do EEG durante a interpretação de suprassegundos. Material e Métodos: Cento e setenta e oito homens (18-32 anos de idade) foram genotipados para os polimorfismos SLC6A3 3'-UTR e intron 8 VNTRs. Além disso, foi realizada a eletroencefalografia, tendo como foco a atividade do córtex pré-frontal dorsolateral concomitante à tarefa de estimativa de tempo. Os polimorfismos 3'-UTR e intron 8 VNTRs foram associados ao erro absoluto e ratio em uma tarefa com estímulo visual de estimativa de tempo (duração alvo: 1s, 4s, 7s e 9s), bem como a potência da banda alfa do EEG. Resultados: Em relação ao erro absoluto e ao ratio, a análise combinatória do SLC6A3 3'-UTR e intron 8 VNTRs apresentou diferença na interpretação do tempo apenas para 1s (p≤0,0125). Na análise de potência alfa do EEG houve diferença apenas para o CPFDL esquerdo (p=0,0002). Conclusão: Investigações eletrofisiológicas e comportamentais na percepção do tempo associada ao gene SLC6A3 sugerem uma avaliação alternativa dos aspectos neurobiológicos embutidos na temporização. Os polimorfismos 3'-UTR e intron 8 VNTRs em conjunto podem modular a sinalização dopaminérgica durante o julgamento da escala temporal curta e indicar um papel nos inputs neurais do CPFDL esquerdo durante os processos de percepção voluntária para estímulo visual.