Banca de DEFESA: DEYLANE MENEZES TELES E OLIVEIRA

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: DEYLANE MENEZES TELES E OLIVEIRA
DATA: 22/12/2020
HORA: 09:00
LOCAL: Plataforma Google Meet
TÍTULO: pHLA3D: O Banco de Estruturas Tridimensionais, preditas, para Moléculas HLA
PALAVRAS-CHAVES: Modelagem por homologia, Estrutura 3D, Moléculas HLA, predição.
PÁGINAS: 76
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Biologia Geral
RESUMO:

A bioinformática permeia, na atualidade, praticamente todos os aspectos das ciências da vida, variando de estudos de sequências de ácidos nucleicos e modelagem de estrutura proteica a mecanismos de interações entre proteínas. Por apresentarem resultados confiáveis, rápidos e a um baixo custo, ferramentas de bioinformática estão cada vez mais sendo utilizadas em áreas das ciências biomédicas, principalmente no que tange à predição de estruturas tridimensionais. A ideia é estudar processos complexos como função de biomoléculas, interação de proteínas específicas, formulação, planejamento e otimização de fármacos, in sílico, testando os resultados mais promissores in vitro. Nesse sentido, a modelagem por homologia, o mais preciso dos métodos de predição de estrutura computacional, tem sido utilizado por diferentes grupos de pesquisadores para a predição de estruturas 3D proteicas, a partir de proteínas relacionadas. A despeito de todo esse potencial, no entanto, o uso de bioinformática para a construção de modelos proteicos preditos tem sido pouco explorado na área da imunogenética, justamente aquela que lida com moléculas HLA, as mais polimórficas e diversas que se conhece em humanos. A construção de modelos preditos de moléculas HLA é um passo importante para a realização de estudos envolvendo essas moléculas, cujas estruturas conhecidas limita-se a poucas moléculas resolvidas por cristalografia de raios X. Tal descompasso entre a necessidade de estruturas tridimensionais de alta qualidade de proteínas HLA e o número insatisfatório de tais estruturas nos bancos de dados atualmente disponíveis pode ser resolvida pela criação, in sílico, de um banco de dados de estruturas tridimensionais preditas para as referidas moléculas. Com esse racional em mente desafiamo-nos a criar o Banco de estruturas tridimensionais preditas para moléculas HLA. A estratégia inicial foi a predição de modelos 3D para cada um dos alelos presentes nos kits de ensaios de fase sólida atualmente comercializados e utilizados pelos laboratórios de imunogenética em testes de PRA (Panel of Reactivity of Antibody), tanto para HLA de classe I, como para de classe II. A estratégia experimental foi a modelagem por homologia, utilizando ferramentas de uso público altamente confiáveis e de ampla aceitação pela comunidade científica mundial. O resultado foi a criação de moléculas HLA de classe I (locus A= 33; locus B= 54 e locus C=19) e de classe II (locus DR= 42; locus DQ= 42 e locus DP = 44), disponibilizadas online em: phla3d.com.br.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1716862 - ADALBERTO SOCORRO DA SILVA
Externo ao Programa - 2157495 - ANDERSON NOGUEIRA MENDES
Externo ao Programa - 1737174 - FABIO BARROS BRITTO
Externo ao Programa - 473.733.503-72 - RICARDO MARTINS RAMOS - IFPI
Interno - 1247107 - SEMIRAMIS JAMIL HADAD DO MONTE