Banca de DEFESA: AURINO DE ARAUJO REGO NETO

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: AURINO DE ARAUJO REGO NETO
DATA: 10/03/2017
HORA: 14:00
LOCAL: Núcleo de Pós-graduação em Ciências Agrárias
TÍTULO: Arquitetura genética e associação genômica ampla para características de tamanho corporal em ovinos Santa Inês
PALAVRAS-CHAVES: Associação genômica ampla, endogamia, desequilíbrio de ligação, ovinos de corte, parentesco realizado, segmentos de homozigose
PÁGINAS: 80
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Zootecnia
SUBÁREA: Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
RESUMO:

O conhecimento da arquitetura genética de uma população permite identificar fatores que podem interferir na eficiência do progresso genético pela seleção. Objetivou-se com este estudo avaliar a arquitetura genética por meio de analise tradicional e genômica, bem como a detecção de polimorfismos únicos de DNA associados a características de tamanho corporal de animais da raça Santa Inês.  Para tanto, foram utilizados informações de 428 animais criados nos estados do Piauí e Maranhão com registro na Associação Brasileira de Criadores de Ovinos, dos quais foram genotipados 271, utilizando-se SNPs Chip de alta densidade Ovine 50K da Illumina. Após o controle de qualidade, foram utilizados 51.874 SNPs. No Capitulo 1,  foram utilizados dois métodos diferentes para calcular o parentesco entre os animais, matriz de relacionamento genético tradicional (A), baseado na informação de pedigree , e a matriz de relacionamento genético genômico (G), baseada nos marcadores SNP's. Quatro critérios foram utilizados e comparados para estimar a endogamia, informações pedigree (FPED); corrida de homozigose (FROH), frequência de homosigose observada e esperada (FHOM) e a matriz de relacinamento genômico (FGRM). Com a estatística r² estimou-se a extensão do desequilíbrio de ligação entre pares de SNPs adjacentes presentes nos cromossomos autossômicos. A identificação dos segmentos de homozigose (ROH) nos cromossomos autossômicos foi realizada considerando pelo menos 50 SNPs homozigotos em um  segmento mínimo de 1.000 Kb por animal. O desequilíbrio de ligação (LD) r² foi de 0,4443. Os coeficientes de endogamia médios estimados FPED, FROH, FHOM, FGRM, foram 0,0004 0,035, 0,025, e 0,552 respectivamente. As estimativas de parentesco médio baseados em A e G foram, respectivamente, 0,02 e 0,255. Foram identificados 4.022 seguimentos de homozigose no genoma, dos quais se destacam três regiões no cromossomo 16 que foram compartilhadas por mais de 50% da população, o que pode indicar a ocorrência de seleção intensa para características cuja a expressão estão reguladas por genens localizados neste cromossomo. No Capitulo 2, para verificar a associação marcadores SNP’s com características de tamanho corporal realizou-se uma análise de associação genômica ampla (GWAS) por meio da metodologia GWAS passo único (ssGBLUP) para estimar os efeitos de marcadores e associá-los às características peso a idade adulta (PA), comprimento corporal (CC), altura da cernelha (AC),  circunferência torácica (CT), comprimento da perna (CP) e perímetro da perna(PP). Observaram-se associações com PA, CP e PP no cromossomo 6, com CT nos cromossomos 4, 7 e 13 e com AC e CC no cromossomo 4. As regiões identificadas neste estudo apresentam vários genes com conhecimento biológico descrito que poderão auxiliar na melhor compreensão da expressão destas características, assim como, poderão auxiliar nas tomadas de decisões em programas de seleção da raça Santa Inês.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1550485 - JOSE LINDENBERG ROCHA SARMENTO
Interno - 1167774 - JOSE ELIVALTO GUIMARAES CAMPELO
Externo ao Programa - 1737174 - FABIO BARROS BRITTO
Externo ao Programa - 2993761 - NATANAEL PEREIRA DA SILVA SANTOS
Externo à Instituição - LUIZ ANTONIO SILVA FIGUEIREDO FILHO - IFMA
Externo à Instituição - MARCOS JACOB DE OLIVEIRA ALMEIDA - EMBRAPA