O Programa iniciou suas atividades em 2009, com a oferta do Curso de Mestrado Acadêmico em Matemática, a partir de uma associação temporária com a Universidade Federal do Ceará por um período de 4 (quatro) anos. Até o presente momento, o programa experimentou considerável evolução, em particular, as áreas e linhas de pesquisas foram adequadas tornando-se mais abrangentes a fim de melhor enquadrar-se à heterogeneidade de seu corpo docente. Atualmente, o programa tem como áreas de concentração Análise, Geometria e Topologia, e Matemática Aplicada. O corpo docente experimentou uma ascensão quantitativa e qualitativa, isso permitiu maior diversidade na pesquisa realizada bem como acolhimento qualificado do corpo discente. O programa apresenta excelente evolução, consolidação, crescimento com forte impacto regional, índice de formação discente bom e produção científica sólida para as referências da área. Como consequência disso, o programa obteve nota 4 na avaliação quadrienal da CAPES (2013-2016) e também teve o APCN para criação do Curso de Doutorado Acadêmico aprovado, cujas atividades iniciaram em março de 2019. O programa representa a primeira Pós-graduação Stricto Sensu em Matemática implantada no Piauí. Vale também observar a inexistência de Doutorado em Matemática nos estados do Maranhão e Tocantins, e a inexistência de Doutorado com a linha de pesquisa em Otimização na região Nordeste, o que torna o doutorado em Matemática ofertado pela UFPI uma boa opção para a região Nordeste/Centro-Norte.