Constitui objetivo do PPGCA qualificar recursos humanos de excelência em nível de Pós-graduação em Ciências Agrárias para atuar nas instituições públicas ou privadas de ensino e pesquisa e em empresas dos setores agrário e ambiental, além de promover, junto aos estudantes, uma visão inovadora e empreendedora como alternativa de atuação profissional nos âmbitos nacional e internacional.
O PPGCA tem por objetivos específicos capacitar seus alunos de mestrado e de doutorado em quatro linhas de pesquisa nas Ciências Agrárias:
1. Fertilidade, biologia do solo e nutrição de plantas
2. Recursos ambientais, uso e manejo do solo e da água
3. Propagação e manejo de plantas
4. Proteção de plantas
Os impactos na sociedade oriundos da produção intelectual do PPGCA incluem tanto aspectos regionais quanto internacionais. Os produtos gerados são bastantes diversificados, incluindo artigos, livros, capítulos de livro, notas técnicas, os quais compreendem caráter inovador nas diferentes linhas de pesquisa do programa.